ガマ星雲第58番惑星「ケロン星」から地球（地球外の全宇宙人の呼称はポコペン）の侵略を目的に軍
隊が派遣された。その先発隊として隊長・ケロロ軍曹、機動歩兵・ギロロ伍長、暗殺兵・ゼロロ兵長（後にドロロと改名）、突撃兵・タママ二等兵、作戦通信参
謀・クルル曹長の5人の兵士からなる宇宙侵攻軍特殊先行工作部隊・ケロロ小隊が地球に降り立った。しかし、地球に降り立つ際に5人は散り散りになってしま
う。隊長であるケロロ軍曹は、はぐれてしまった仲間たちを探し出し小隊の立て直しを図るべく一軒の民家・日向家に潜伏するが、偶然にも住民に発見・捕獲さ
れてしまい、秘密裏に進めるはずだった地球侵略は失敗に終わる。本隊は彼ら先発隊の5人を残して撤退してしまった。こうして地球に取り残された5人のケロ
ン人は、侵略するはずの相手と同居するという奇妙な生活を始めることとなる。
第1話 我輩がケロロ軍曹 / ケロロ大地に立つ
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第2話 桃華＆タママ出撃! / 桃華＆タママ 日向家上陸
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第3話 ケロロ 危険臨界点突破 / ケロロ 極秘任務開始
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第4話 ギロロ 宇宙で最も危険な男 / ケロロ 雨時々危険な男
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第5話 おもちゃを愛する男達の歌
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第6話 桃華 ラブラブ南海大作戦 / 桃華 ひゅ～どろ南海大作戦
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第7話 モア はじめての地球破壊 / タママvsモア 結果はタママの負け
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第8話 ケロロ 侵略作戦絶好調! / ケロロ 間違いだらけの基地作り
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第9話 夏美 恋の行く手に来るクルル / 日向秋 ダイナマイトな女
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第10話 決戦! 第三大臼歯
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第11話 ケロロ小隊 テレビに出演せよ!
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第12話 すもも アイドルは宇宙をこえて / ギロロ 戦場のちいさな天使
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第13話 ドロロ 忘れられた戦士 / ドロロ＆小雪 友情は美しき哉
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第14話 五人集結! たぶん史上最大の作戦
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第15話 桃華 裏桃華 降臨 / 裏桃華 裏切りの裏側
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第16話 モア 裏モア 降臨!? / モア モアモア大パニック
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第17話 ケロロvs夏美 水中大決戦! / 冬樹 ようこそホラーワールドへ
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第18話 夏美 爆笑! オトナの海岸物語
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第19話 ケロロvs夏美 おまつり頂上決戦! / ケロロ あなたのお耳に侵略ラジオ
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第20話 冬樹 ミーツ・ア・ガァ～ル / 冬樹 ノントルマの使者
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第21話 ケロロ 侵略も省エネでね / ケロロ 田舎にむけて突撃せよ!
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第22話 タママ 今日からボクが隊長ですぅ
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第23話 パニック! 日向家の最も騒がしい一日
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第24話 ケロロ 正義と貧乏の宇宙探偵 / 556 特撮就職最前線!
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第25話 桃華 愛と青春と波乱の逃亡
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第26話 ケロロ 一致団結! 運動会を侵略せよ
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第27話 ケロロ 父キタル父カエル / ケロロ 温泉GO! GO! GO!
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第28話 ケロロ 雪合戦サバイバル / クルル クックックのクッ
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第29話 夏美＆小雪 舞台にかける青春 / ケロロ スクープはNG!
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第30話 タママ ケロン星から来た少年 / 桃華 めざせナイスバディ
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第31話 ケロロ 帰りたい 帰れない…
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第32話 ケロロ 動物隊員大集合 / ギロロ ネコは言いたい
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第33話 ケロロ小隊 アニメでペコポン侵略
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第34話 桃華vs小雪 温泉争奪バトル / ケロロ＆冬樹 まったり行こっ
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第35話 極秘! 夏美のお誕生日大作戦
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第36話 ケロロ 死闘! 軍曹vs冬将軍 / 冬樹 そ～なんですよ西澤さん
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第37話 ドロロ きたれ忍者教室へ / ケロロの恐竜
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第38話 ギロロ 愛の機動歩兵 / ギロロvs夏美 めぐりあい…も
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第39話 ケロロ クリスマス大作戦 / ケロロ 仕事納めの大掃除
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第40話 モアていうか謹賀新年？ / ケロロ おせちもいいけど宿題もね
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第41話 ケロロ すごろく攻略戦 / ドロロ もーれつに熱血せよ
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第42話 ケロロ 赤き血のケロロ小隊 / タママ 友情の嫉妬シュート!
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第43話 ギロロ 泣けない赤鬼 / ギロロ 飛び出せ節分!
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第44話 ケロロvs冬樹 スポーツで決闘 / クルルvs秋 侵略ロボで爆闘
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第45話 ケロロ 愛のいきなりだんご / 夏美＆桃華 Ｖ作戦発動！
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第46話 ケロロ あなた忘れられていませんか？
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第47話 夏美 ひなまつりを守れ / ケロロ アフロでみゃおん
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第48話 ケロロ小隊 春のうららの大作戦 / 冬樹 ダメダメハザード救出作戦
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第49話 クルル 宇宙でうまくやる方法 / 桃華 Ｗ-デイ頂上作戦
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第50話 夏美 高熱の地球戦士! ギロロ 俺がやらねば誰がやる
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第51話 ケロロ小隊撤退! さらばペコポンよ(終)
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